祖大寿愤怒已极，然而却已无可奈何，只能束手无策，仰天长叹。城内大明副将以下官十七人、兵八千余人被害身亡，被俘一万二千四百多人，损失甲兵七千二百多件，各种火器六百多门。

四月中旬，皇太极招降抚杏山明军被拒，二十一日，济尔哈朗率军攻城。

二十二日，清虏以红夷大炮轰塌城墙二十五丈余，副将吕品奇投降，杏山失守。明军被俘六千八百多人，甲兵二千七百多件，各种火器八百五十多门。

五月，洪承畴终于被皇太极的怀柔政策所打动，剃发降清。

至此，吴三桂镇守的宁远卫地区，成为了大明朝在辽东最后一座没有失陷大型城池，也是最重要的一个战略防御中心。

崇祯十五年八月，皇太极因前次带病出征而导致病势严重，暴病身亡，他六岁的儿子接了他的位。

九月，济尔哈朗和八旗军第一猛将多罗武英郡王阿济格便除去丧服，率军对宁远地区再次发起了大规模的进攻。他们先绕开宁远，攻打宁远以西至山海关一线的中后所、中前所、前屯卫这三个明军卫所，中后所、前屯卫首先沦陷，其中的中前所守将总兵黄色弃城逃跑，导致中前所未经战斗便落入敌手。

这三个防御据点的被毁，使宁远与山海关之间的整体防线被破坏，宁远成了一座真正的孤城。

恶劣的局面，让一部分关宁军将士开始动摇。如宁远城内的守备孙友白，便于十二月偷偷越城而出，投降了清虏。

然而在如此极端不利的情况下，吴三桂最后还是领军击退了济尔哈朗和阿济格对宁远的进攻，一直到现在，还没发现清虏有再次进犯的迹象。