在除董卓的过程中，

他一直隐身幕后，向董卓发起一波又一波的进攻。四川朝廷士人刺杀董卓的行动一共有两次。

这两次行动虽然是分别进行的，在史书记载中也给割裂开来，但有迹象表明，这两次行动是同一个计划，其幕后策划人是王允。

第一次刺杀是由越骑校尉伍孚执行的，结果失败了，抓了好多人，连荀攸这位天下智者都没有逃出去，但是王允却连一根毫毛也没有伤到。

第二次联络吕布，吕布刺杀董卓的行动中，需要一份讨董卓的诏书。此时王允身为尚书令。

本来负责所有诏书的起草下达，但他不起草，而是让他的副手士孙瑞来起草。这个人是很狡猾的。

可是，他的这种狡猾，也只是士人的狡猾，但士人手中没有武力，士人的武力在关东，在荆州、扬州、兖州和冀州，不在王允手中。

王允视刘备等人为好友，但是他们帮不上忙。

本来王允以为，自己这里一发动，很快就能见到举国而来的义士忠臣，大家一起共扶汉室。

这小小的西凉军群龙无首，自然翻不起大浪来，但是王允失望了，他早就派出人马去通知各地了，别说兵马，连一个回封信的人都没有。

王允是又急，又气，又失望，又彷徨。

他比吕布明白，眼下的情形简直是太危险了。西凉军中一人倡议，只怕就万夫景从，扑天盖地而来的将不是勤王义军，而是西凉叛军了。